首发院的根本研究任务是直面新时期增强首都功能、有序疏解北京非首都功能，解决大城市病，谋求京津冀协同发展的需要，针对首都发展决策所面临的一系列重大现实问题展开全面系统的研究。首发院以立足于满足首都发展决策需要为第一要务，直接为北京市政府以及中央相关首都决策机构提供决策咨询；也同时尊重大都市发展规律，注重研究全国其他大都市发展，以及注重研究世界其他国家大都市地区，特别是首都地区发展的经验和教训，为首都北京提供咨政服务。

“首都核心功能研究”板块的学术任务是直接服务于增强首都核心功能决策所需要的咨政研究。该平台紧紧围绕如何强化首都北京作为全国政治中心、文化中心、国际交往中心、科技创新中心这四大首都核心功能展开研究，深化研究该四大核心功能的内涵、外延，北京发展如何充分增强四大核心功能，如何创造条件来满足四大核心功能的需要，并为此建构首都发展的体制机制；“都市发展治理研究”板块的学术任务是瞄准北京建设成国际一流的和谐宜居之都的战略目标，总结大都市发展的一般规律，在经济治理、社会治理、生态治理、空间治理、区域治理等 5 个大都市发展治理的关键领域，针对首都北京有序疏解非首都功能，解决大城市病、推动京津冀协同发展中所遇到的突出问题和障碍，根据深入推进全面改革、落实创新驱动发展战略和贯彻供给侧结构性改革等国家重大改革任务和制度创新设计，进行多学科、系统性的协同创新研究。两大研究方向相辅相成，共同支撑首都发展决策，服务四个中心建设。增强首都核心功能的落实需要具体体现为首都北京经济社会多方面的高端发展，是北京市发展治理研究的特殊对象；都市发展治理研究如何有序疏解非首都功能，解决大城市病，在经济、社会、生态、空间领域建立良好的运行秩序，有效促进京津冀协同发展进程，为增强首都核心功能提供必要的基础性保障。

首都核心功能研究方向衍生出政治中心、文化中心、国际交往中心和科技创新中心 4 大研究平台；都市发展治理研究方向则衍生出经济治理、空间治理、京津冀协同发展、人口与社会治理以及环境治理 5 大研究平台。